Im Fokus von Das Zeiträtsel liegt das hochbegabte Mädchen Meg Murray, die eigentlich nur eine normale Kindheit haben möchte. Als ihr Vater, ein angesehener Physiker verschwindet und Meg die Arbeit entdeckt, an der ihr verschollener Vater zuletzt gearbeitet hat, beginnt eine abenteuerliche Reise durch Zeit und Raum und führt sie zum Ursprung von Licht und Dunkelheit.